Faton Peci u lind më 16.06.1982 në Mitrovicë. Shkollimin fillor dhe të mesëm e kreu në Mitrovicë, ndërsa studimet i vazhdoi në Universiteti i Prishtinës, në drejtimin Shkenca Politike dhe Filozofi, duke vazhduar edhe studimet master në të njëjtin drejtim.

Deri në vitin 2008, Faton Peci punoi si konsulent për organizata prestigjioze ndërkombëtare si OSCE, UNICEF dhe UNDP, duke kontribuar në hartimin e politikave programore, legjislacionit dhe strategjive.

Pas këtyre projekteve, ai vazhdoi për një vit si konsulent i Ministria e Administrimit të Pushtetit Lokal në projektin për vlerësimin dhe plotësimin e ndryshimeve të Ligjit për Ndërmarrjet Publike në proces transformimi dhe ndërmarrjet me shoqëri aksionare.

Gjatë viteve 2010–2014, z. Peci punoi si konsulent në projekte të KFOS, të financuara nga Qeveria e Norvegjisë, me fokus në ngritjen e kapaciteteve institucionale dhe mbështetjen për Ministria e Kulturës, Rinisë dhe Sportit, si dhe në projekte të UNDP për hartimin dhe monitorimin e strategjive institucionale.

Aktivitetin e tij politik e filloi në vitin 2008, kur mori detyrën e zëdhënësit të degës së Lidhja Demokratike e Kosovës në Mitrovicë, duke vazhduar më pas si sekretar për marrëdhënie me jashtë. Më vonë ishte anëtar i Kuvendit Komunal, ndërsa gjatë viteve 2010–2015 ishte anëtar i Këshillit të Përgjithshëm të LDK-së.

Më tej, z. Faton Peci ushtroi detyrën e këshilltarit politik të zëvendëskryeministrit dhe ministrit të Kulturës, Rinisë dhe Sportit. Në vitet 2020–2021 ishte këshilltar politik në Kuvendi i Kosovës, si dhe shef i kabinetit të presidentes së Kosovës.

Në zgjedhjet e shkurtit 2021 fitoi besimin e qytetarëve për t’u zgjedhur deputet, ndërsa në mars të po atij viti u emërua ministër i Ministria e Bujqësisë, Pylltarisë dhe Zhvillimit Rural.

Që nga data 07.09.2022, ai është bashkëkryetar i Partia GUXO.